Polyacrylonitrile 3-mer

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PAn 3-mer TOP



 * OPLS-AA topology, built by TopolGen version 1.1_dev (10/14/2009)


 * Script written by: Justin Lemkul (jalemkul@vt.edu)


 * This is your molecule's topology


 * Check it carefully for any errors. It is not necessarily perfect!




 * Topology written on Wed Jul  3 17:31:42 EDT 2013




 * Include force field


 * 1) include "ffoplsaa.itp"

[ moleculetype ]


 * Name            nrexcl

LIG                 3

[ atoms ]


 * nr       type  resnr residue  atom   cgnr     charge       mass  typeB    chargeB      massB

1   opls_135      1    LIG      C      1     -0.180   12.01100

2   opls_135      1    LIG      C      2     -0.180   12.01100

3   opls_140      1    LIG      H      2      0.060    1.00800

4   opls_140      1    LIG      H      2      0.060    1.00800

5   opls_140      1    LIG      H      2      0.060    1.00800

6          1      0      C      2     12      0.000    0.00000

7   opls_140      1    LIG      H      2      0.060    1.00800

8   opls_906      1    LIG      C      3      0.060   12.01100

9          1      0      N      3     14      0.000    0.00000

10   opls_140      1    LIG      H      3      0.060    1.00800

11   opls_137      1    LIG      C      4     -0.060   12.01100

12   opls_140      1    LIG      H      4      0.060    1.00800

13          1      0      C      4     12      0.000    0.00000

14   opls_140      1    LIG      H      4      0.060    1.00800

15   opls_137      1    LIG      C      5     -0.060   12.01100

16   opls_140      1    LIG      H      5      0.060    1.00800

17   opls_137      1    LIG      C      6     -0.060   12.01100

18   opls_140      1    LIG      H      6      0.060    1.00800

19          1      0      C      6     12      0.000    0.00000

20   opls_140      1    LIG      H      6      0.060    1.00800

21   opls_140      1    LIG      H      6      0.060    1.00800

22          1      0      N      6     14      0.000    0.00000

23          1      0      N      6     14      0.000    0.00000

[ bonds ]


 * ai    aj funct

1     2     1 ;     C     C

1     3     1 ;     C     H

1     4     1 ;     C     H

1     5     1 ;     C     H

2     6     1 ;     C     C

2     7     1 ;     C     H

2     8     1 ;     C     C

6     9     1 ;     C     N

8    10     1 ;     C     H

8    11     1 ;     C     C

8    12     1 ;     C     H

11    13     1 ;     C     C

11    14     1 ;     C     H

11    15     1 ;     C     C

13    22     1 ;     C     N

15    16     1 ;     C     H

15    17     1 ;     C     C

15    18     1 ;     C     H

17    19     1 ;     C     C

17    20     1 ;     C     H

17    21     1 ;     C     H

19    23     1 ;     C     N

[ pairs ]


 * ai    aj funct

1     9     1 ;     C     N

1    10     1 ;     C     H

1    11     1 ;     C     C

1    12     1 ;     C     H

6    10     1 ;     C     H

6    11     1 ;     C     C

6    12     1 ;     C     H

7    10     1 ;     H     H

7    11     1 ;     H     C

7    12     1 ;     H     H

2    13     1 ;     C     C

2    14     1 ;     C     H

2    15     1 ;     C     C

10    13     1 ;     H     C

10    14     1 ;     H     H

10    15     1 ;     H     C

8    22     1 ;     C     N

8    16     1 ;     C     H

8    17     1 ;     C     C

8    18     1 ;     C     H

13    16     1 ;     C     H

13    17     1 ;     C     C

13    18     1 ;     C     H

14    16     1 ;     H     H

14    17     1 ;     H     C

14    18     1 ;     H     H

11    19     1 ;     C     C

11    20     1 ;     C     H

11    21     1 ;     C     H

16    19     1 ;     H     C

16    20     1 ;     H     H

16    21     1 ;     H     H

15    23     1 ;     C     N

[ angles ]


 * ai    aj    ak funct

2     1     3     1 ;     C     C     H

2     1     4     1 ;     C     C     H

2     1     5     1 ;     C     C     H

1     2     6     1 ;     C     C     C

1     2     7     1 ;     C     C     H

1     2     8     1 ;     C     C     C

3     1     4     1 ;     H     C     H

3     1     5     1 ;     H     C     H

4     1     5     1 ;     H     C     H

6     2     7     1 ;     C     C     H

6     2     8     1 ;     C     C     C

2     6     9     1 ;     C     C     N

7     2     8     1 ;     H     C     C

2     8    10     1 ;     C     C     H

2     8    11     1 ;     C     C     C

2     8    12     1 ;     C     C     H

10     8    11     1 ;     H     C     C

10     8    12     1 ;     H     C     H

11     8    12     1 ;     C     C     H

8    11    13     1 ;     C     C     C

8    11    14     1 ;     C     C     H

8    11    15     1 ;     C     C     C

13    11    14     1 ;     C     C     H

13    11    15     1 ;     C     C     C

11    13    22     1 ;     C     C     N

14    11    15     1 ;     H     C     C

11    15    16     1 ;     C     C     H

11    15    17     1 ;     C     C     C

11    15    18     1 ;     C     C     H

16    15    17     1 ;     H     C     C

16    15    18     1 ;     H     C     H

17    15    18     1 ;     C     C     H

15    17    19     1 ;     C     C     C

15    17    20     1 ;     C     C     H

15    17    21     1 ;     C     C     H

19    17    20     1 ;     C     C     H

19    17    21     1 ;     C     C     H

17    19    23     1 ;     C     C     N

20    17    21     1 ;     H     C     H

[ dihedrals ]


 * ai    aj    ak    al funct

1     2     6     9     3 ;     C     C     C     N

1     2     8    10     3 ;     C     C     C     H

1     2     8    11     3 ;     C     C     C     C

1     2     8    12     3 ;     C     C     C     H

6     2     8    10     3 ;     C     C     C     H

6     2     8    11     3 ;     C     C     C     C

6     2     8    12     3 ;     C     C     C     H

7     2     8    10     3 ;     H     C     C     H

7     2     8    11     3 ;     H     C     C     C

7     2     8    12     3 ;     H     C     C     H

2     8    11    13     3 ;     C     C     C     C

2     8    11    14     3 ;     C     C     C     H

2     8    11    15     3 ;     C     C     C     C

10     8    11    13     3 ;     H     C     C     C

10     8    11    14     3 ;     H     C     C     H

10     8    11    15     3 ;     H     C     C     C

8    11    13    22     3 ;     C     C     C     N

8    11    15    16     3 ;     C     C     C     H

8    11    15    17     3 ;     C     C     C     C

8    11    15    18     3 ;     C     C     C     H

13    11    15    16     3 ;     C     C     C     H

13    11    15    17     3 ;     C     C     C     C

13    11    15    18     3 ;     C     C     C     H

14    11    15    16     3 ;     H     C     C     H

14    11    15    17     3 ;     H     C     C     C

14    11    15    18     3 ;     H     C     C     H

11    15    17    19     3 ;     C     C     C     C

11    15    17    20     3 ;     C     C     C     H

11    15    17    21     3 ;     C     C     C     H

16    15    17    19     3 ;     H     C     C     C

16    15    17    20     3 ;     H     C     C     H

16    15    17    21     3 ;     H     C     C     H

15    17    19    23     3 ;     C     C     C     N

[ system ]


 * Name

LIG topology, generated by TopolGen

[ molecules ]


 * Compound        #mols

LIG                 1