Ethanol

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Ethanol PDB
9

EtOH

HETATM    1  C   EtOH   1      -2.214   2.450   0.119  1.00  0.00

HETATM    2  C   EtOH   1      -0.691   2.407   0.134  1.00  0.00

HETATM    3  H   EtOH   1      -2.626   1.575   0.665  1.00  0.00

HETATM    4  H   EtOH   1      -2.584   2.434  -0.928  1.00  0.00

HETATM    5  H   EtOH   1      -2.567   3.380   0.612  1.00  0.00

HETATM    6  O   EtOH   1      -0.228   1.251  -0.508  1.00  0.00

HETATM    7  H   EtOH   1      -0.309   2.452   1.179  1.00  0.00

HETATM    8  H   EtOH   1      -0.293   3.294  -0.402  1.00  0.00

HETATM    9  H   EtOH   1      -0.344   0.503   0.134  1.00  0.00

CONECT    1    2    3    4    5

CONECT    1

CONECT    2    1    6    7    8

CONECT    2

CONECT    3    1

CONECT    4    1

CONECT    5    1

CONECT    6    2    9

CONECT    7    2

CONECT    8    2

CONECT    9    6

MASTER        0    0    0    0    0    0    0    0    9    0    9    0

END

Ethanol TOP
; ; Ethanol, Jorgensen et al. JACS 118 pp. 11225 (1996) ; [ moleculetype ] ; name nrexcl ETH	3 [ atoms ] ;  nr    type   resnr  residu    atom    cgnr        charge          mass 1      opls_157       1     ETH       C       1	-0.18 2      opls_156       1     ETH       H       1	0.06 3      opls_156       1     ETH       H       1	0.06 4      opls_156       1     ETH       H       1	0.06 5      opls_157       1     ETH       C       2	0.145 6      opls_156       1     ETH       H       2	0.06 7      opls_156       1     ETH       H       2	0.06 8      opls_154       1     ETH      OA       2	-0.683 9      opls_155       1     ETH      HO       2	0.418 [ bonds ] ; ai    aj funct           c0           c1  1	5	1 3	1	1 4	1	1  2	1	1  7	5	1  6	5	1  8      5       1  9      8	1  [ pairs ] ; i	j	func 2	6 2	7  2	8  3	6  3	7  3	8  4	6  4	7  4	8  1	9  6	9  7	9 [ angles ] ; ai    aj    ak funct           c0        c1 ; H3  2	1	5	1 3	1	5 	1  4	1	5	1 ;  4      1       3 	1  4	1	2	1 ;  3	1	2	1 ;  1	5	7	1  1	5	6	1  1	5	8	1 ;  5	8	9	1 ;   6	5	7	1  6	5	8	1 ;  7	5	8	1 ; [ dihedrals ] 2     1       5      6	3  3      1       5      6	3  4      1       5      6	3  2      1       5      7	3  3      1       5      7	3  4      1       5      7	3  2      1       5      8	3  3      1       5      8	3  4      1       5      8	3  1	5	8      9	3  6	5	8      9	3  7	5	8      9	3